Cerca del final del Siglo XX, una pequeña nación armada llamada Outer Heaven está amenazando a las naciones del Oeste con el desarrollo de un nuevo arma denominado Metal Gear, un tanque andante capaz de lanzar cabezas nucleares desde cualquier parte del mundo. Como nuevo recluta de la unidad de las fuerzas especiales Fox-Hound, tu misión es infiltrarte en Outer Heaven y rescatar a un compañero capturado mientras recolectas toda la información posible sobre los Metal Gear.