El malvado Dr. Robotnik ha capturado a muchos de los amigos animales de Sonic y los ha atrapado en el interior de robots. Afortunadamente, Sonic puede liberarlos sin más que destruir dichos robots con su ataque rodante. Mientras tanto, el Dr. Robotnik está tratando de controlar las poderosas esmeraldas del caos. Sonic también deberá recuperarlas antes de que el villano consiga controlarlas.