Continuamos la historia de Chell, la mujer que derrotó al ordenador de inteligencia artificial GLaDOS en la primera entrega de <em>Portal</em>. Tras haber superado las pruebas del primer juego, Chell es puesta en hibernación y sometida a más experimentos en las instalaciones de Aperture Science. Un día algo parece haber cambiado, los laboratorios están deteriorados y ruinosos. Chell vuelve a ser sometida a más pruebas, sin embargo esta vez tendrá la oportunidad de saltar los controles de seguridad y comprobar qué ocurre tras los blancos muros de las cámaras de prueba.